Le Congrès est l'instance suprême du SEI. Aux fins de la représentation à un congrès, chaque section locale a droit à une déléguée ou un délégué avec plein droit de vote pour chaque tranche de deux cent (200) membres en règle ou fraction de ce nombre dans l’année civile précédant la date du congrès. Tous les délégués et déléguées doivent être membres en règle de la section locale. Ces délégués et déléguées élisent les dirigeants nationaux du SEI, et leurs donnent la direction à suivre.
Les décisions du Congrès sont exécutoires. C'est aussi lors de cette activité que les statuts et règlements du SEI sont adoptés, modifiés ou abrogés. Les budgets nécessaires à l'administration du syndicat y sont aussi adoptés. Cette activité est tenue à tous les trois ans.
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